东京都28日新增确诊病例112例，累计确诊4059例，约占日本确诊病例总数三分之一。
据日本厚生劳动省截至28日的统计数据，日本已有3187人出院。此外“钻石公主”号邮轮确诊712人中死亡13人，651人出院。
在检测能力方面，日本厚生劳动省统计的截至28日累计检测人数约16万人。日本内阁官房长官菅义伟28日表示，目前日本每天检测能力达到1.5万份，将进一步采取措施争取提升到每天2万份。
日本全国紧急状态将于5月6日到期。日本医师会常任理事、日本政府专家小组成员釜萢敏28日表示，日本自16日宣布全国紧急状态以来的疫情发展并未达到预期，他认为有必要在全国范围继续延长紧急状态。日本医师会会长横仓义武也在当天表示，全国不能一起解除紧急状态，他还呼吁尽可能加紧研发治疗药物和疫苗。
日本国立感染症研究所28日发布一项调查结果称，对各国新冠病毒样本基因组的分析显示，日本国内1月至2月第一波传播的病毒已被成功控制，现在第二波传播的病毒可能是3月份从欧美传入。
受疫情影响，今年日本铁路和航空交通的载客率大幅减少。28日下午，日本铁路公司各趟新干线自由席乘车率不足10%，航空公司大幅减少国内航班架次。
