科创板的设立，将加速科技创新型企业上市，对现有的科技上市公司估值体系会造成一定冲击。整体而言，科技类上市公司的估值体系会更加理性，股价走势会出现明显分化。真正的高科技公司会继续受到青睐，伪科技公司或者科技含量较低的公司估值会不断走低，甚至被淘汰。
科创板的最大亮点是试点注册制，这样一来，就会有很多的科技型企业申请在科创板上市。一方面，面对在科创板上市的科技公司，部分投资者可能会选择从现有的A股科技公司中离场，转而布局科创板，这就给场内的科技公司板块带来一定的分流压力。因而，对于目前的上市科技公司而言，必须要科技含量够高，盈利能力够强，且行业发展够好，才能博得投资者的青睐，否则将会被越来越多的投资者所抛弃。
实际上，A股市场投资者对科技股一直情有独钟，加之科技类公司数量有限，因而投资者一般会对科技类上市公司更为青睐，在股价表现上，只要和科技沾边，公司就能获得较高的估值。这就使得科技类上市公司的估值存在一定的高估。然而，在科创板设立之后，科技类上市公司的供需平衡将被打破，符合科创板投资门槛的投资者们将可能转场，这就使得原本的科技类上市公司股价走势出现分化。尤其是那些伪科技股，在丢失科技股光环之后，股价将向真实的估值水平合理回归。
从投资者结构来看，布局科技股多数以基金等机构主力为主，且多有抱团取暖的迹象。在科创板设立之后，虽然场内标的公司的盈利情况可能不如已经上市的科技公司稳定，但却可能蕴藏着更高的投资回报。这就可能导致部分主力资金离场。另一方面，科技股的炒作主力多以游资大户等为主，从很大程度上来说，科技股的估值体系支撑因素中有游资炒作的成分。然而，当科创板设立之后，游资大户也可能抽出部分资金转战科创板，毕竟新股更容易获得投资者关注和炒作。
从估值水平来看，由于部分资金的离场，存量资金的选择将更为理性和合理，这就使得上市科技股板块的估值水平将更为合理，整体情形可能是出现一定程度的下滑。
当然，科创板不仅是目前上市科技股的试金石，同样还是科创板内科技股的试金石。在试点注册制的背景下，科创板内的上市公司质量可能有较大差别，对应的投资风险也较大。与此同时，科创板可能会设立一定的投资者准入门槛，这就使得投资者的专业水平较高，包括机构在内，它们对科技股的选股、判断能力更强，因而，在科创板内，科技含量同样是十分重要的投资指标，不同质量的科技公司，估值水平、股价走势可能出现重大差异。
